Végétaliens, végétariens, omnivores : la réponse est dans le microbiome

Il est désormais bien connu que la composition du microbiome intestinal est conditionnée par ce que nous mangeons et qui à son tour conditionne notre état de santé global. Cependant, ce que l’on ne savait pas, c’est dans quelle mesure l’empreinte génétique du microbiome est déterminée par ce que nous mangeons. Nourriture pour nourriture. Et type de régime par type de régime. Bref, en analysant le microbiome de chacun de nous, grâce à un séquençage métagénomique qui coûte aujourd’hui quelques centaines d’euros, on est capable de dire si l’on est vegan, végétarien ou omnivore. Comme une sorte de signature.

Cela a été prouvé par une étude portant sur des échantillons de microbiome de 21 561 personnes ayant suivi un régime omnivore, végétalien ou végétarien. Étude menée par un groupe de recherche international et qui vient d’être publiée le Microbiologie naturelle, qui a tenté de répondre à la question de savoir quels aliments modifient le plus – et aussi comment, positivement ou négativement – notre microbiome et d’identifier des bactéries spécifiques liées à la composition de l’alimentation, censées être associées à un meilleur état de santé général. Nous avons interviewé le coordinateur de l’étude, Nicolas Segataprofesseur de génétique et chef du laboratoire de métagénomique computationnelle du département Cibio de l’Université de Trente.

Professeur, selon l’analyse de l’étude, il semblerait qu’en moyenne les végétaliens suivent le régime alimentaire le plus sain, suivis par les végétariens et les omnivores : est-ce vrai ?

« Ce que nous avons découvert, c’est qu’il existe une corrélation très étroite entre ce que vous mangez et les bactéries intestinales, à tel point qu’en examinant les échantillons de microbiome d’une personne, nous sommes en mesure de déterminer si elle suit un régime végétalien, végétarien ou omnivore. »

Quelles sont les principales différences ?

« Le microbiome des omnivores présente une présence plus élevée de bactéries associées à la digestion de la viande, comme Alistipes putredinisimpliquées dans la fermentation des protéines, et un plus grand nombre de bactéries qui, dans d’autres études, ont été associées à des maladies inflammatoires de l’intestin et à un risque accru de cancer du côlon, comme Couples de Ruminocoques Et Bilophile Wadsworthia. Le microbiome végétalien compte un grand nombre de bactéries impliquées dans la fermentation des fibres, dont beaucoup appartiennent à une famille bactérienne appelée Lachnospiracées, e qui ont tendance à être producteurs d’acides gras à chaîne courte, comme le butyrate, qui sont bénéfiques pour la santé intestinale car ils réduisent l’inflammation et maintiennent un meilleur équilibre avec notre métabolisme et notre système immunitaire. Enfin, le microbiome des végétariens, qui consomment des produits d’origine animale, comme les produits laitiers, diffère également de celui des végétaliens en raison de la présence de bactéries considérées comme des probiotiques comme Streptocoque thermophilus, utilisé notamment dans la production de yaourts et de laits fermentés. Les produits laitiers contiennent un grand nombre d’espèces différentes qui ont un impact sur notre microbiome. »

Ces différences substantielles dans les familles bactériennes suggèrent-elles quelque chose ?

« Parallèlement, nous avons constaté que chez les végétaliens, qui consomment une grande quantité de fibres végétales, il existe des bactéries qui contribuent à la production d’acides gras à chaîne courte, largement inconnus et encore anonymes. Des bactéries que nous avons trouvées grâce à la métagénomique et qui sont liées à d’autres les plus connus. De ce point de vue, l’étude suggère que la diversité des aliments d’origine végétale – que l’on soit végétalien ou non – est ce qui a le plus grand impact sur la composition du microbiome, et chacun d’entre eux. groupe de plantes, comme les salades, le brocoli ou autres les légumes ont un impact différent. Et privilégier ces aliments, réduire la viande, notamment la viande rouge et les aliments ultra-transformés, est quelque chose qui améliore le microbiome intestinal. À l’inverse, ne pas manger de viande n’a pas en soi d’effets positifs sur le microbiome si on n’en mange pas. mangez aussi des légumes de différentes qualités, particulièrement riches en fibres ».

Les effets sont-ils les mêmes quel que soit l’endroit où vous habitez et sont-ils uniquement liés à ce que vous mangez ?

« En principe, oui. Même si le mode de vie est évidemment également important, ce qui se reflète dans la qualité du microbiome. Quant aux Italiens, nous savons par d’autres études que le régime méditerranéen a une influence positive sur le microbiome. »

Comment avez-vous recueilli des informations sur le régime alimentaire ?

« Pour les participants à cette étude inscrits à l’initiative ZOE PREDICT, nous disposions d’informations très détaillées collectées à la fois via des questionnaires alimentaires et via une application où les participants, très motivés, saisissaient des informations précises sur ce qu’ils mangeaient. »

Quelle est la prochaine étape ?

« Entre-temps, nous avons continué à collecter des échantillons de microbiome et nous disposons d’environ 150 000 échantillons. Nous disposons également d’informations sur la santé cardiométabolique des participants. Les premières données suggèrent que ceux qui ont un microbiome riche en bactéries qui dégradent la viande rouge ont tendance à avoir une moins bonne santé cardiométabolique, mais il est trop tôt pour savoir dans quelle mesure l’effet de la nourriture est médié par le microbiome. Nous aimerions plutôt essayer de valider des résultats plus clairs avec des interventions pré- et probiotiques, en mesurant le microbiome avant et après. changer de régime ».

Changer la qualité du microbiome pour le rendre « meilleur » ?

« Oui, l’idée est de pouvoir développer une alimentation personnalisée et précise qui utilise des prébiotiques et des choix alimentaires précis pour améliorer la configuration du microbiome qui est spécifique à chacun de nous. Et voir si notre santé s’améliore. »