Nous démantalisons donc l’architecture de chaque tumeur

Il existe des idées dignes des meilleures histoires de science-fiction et qui maintenant, cependant, sont devenues réalité. Pensez simplement à l’intuition de se retirer, de modifier génétiquement puis de compter les cellules du système immunitaire. Pour trouver et décoder l’ADN tumoral à partir d’un échantillon de sang. Pour nourrir des millions d’images cliniques – mammographe, résonances magnétiques, tomodensitométrie, présentes, etc. aux réseaux de neurones – pour faire ressortir les modèles que l’œil humain ne peut pas saisir. Pour cultiver des organoïdes en laboratoire, c’est-à-dire les modèles à trois dimensions de tumeurs cultivées par des cellules prises par de vrais patients.

Qu’est-ce qui viendra alors? Quels sont les avant-postes de la recherche oncologique? Pour nous fournir un télescope avec lequel regarder vers le proche avenir se trouvent trois scientifiques, les invités de la conférence du festival de la santé intitulé « Tumors: The Border », prévu à Padoue le samedi 11 octobre à 9h30: Piero Carnincià la tête du Genomics Research Center – Fonctional Genomics by Human Techopole, Stefano Piccoloprofesseur de biologie moléculaire de l’Université de Padoue, E Anna SapinoDirecteur scientifique de l’Institut de Canolio-IRCCS et professeur d’anatomie pathologique à l’Université de Turin.

Yeux sur le système immunitaire

Le système immunitaire sera de plus en plus le protagoniste. Il y a ceux qui parient ainsi des vaccins thérapeutiques «sur mesure», tels que les ARNm, depuis longtemps). Et vous pariez sur les thérapies basées sur les lymphocytes T tumoraux (note de jargon tels que TIL), les cellules immunitaires trouvées à l’intérieur des tumeurs solides et qui peuvent être prises et multipliées en laboratoire pour créer des « armées » à injecter à nouveau chez les patients. Si vous recherchez quelque chose de plus expérimental, il y a plusieurs fronts: celui de la thérapie génique pour reprogrammer les « tueurs » du système immunitaire, pour transformer les cellules en « chevaux de Troie », pour rendre le micro-salle tumoral inhospitalier et, par conséquent, le transformer en une « mutinerie » contre le néoplasme.

Attentes sur la biopsie liquide et l’ARN « à ordures »

Aussi pour le diagnostic, les scénarios imaginatifs s’ouvrent, avec l’ambition d’identifier les néoplasmes avec des années d’avance par rapport à aujourd’hui, grâce à la biopsie liquide: un défi particulièrement ressenti pour les tumeurs silencieuses, comme celle de l’ovaire. « De nombreuses tentatives pour se tourner vers le sang sont en cours pour augmenter notre capacité à comprendre ce qui arrive au système immunitaire, moment par moment », explique Carninci. « Et il existe plusieurs façons de le faire, pas seulement en regardant l’ADN tumoral circulant. Ce à quoi nous pensons, c’est l’analyse de l’ARN (le transcriptome, Note de l’éditeur) de chaque seule cellule. Cela signifie se retrouver pour gérer de nombreuses données qui seront données à l’intelligence artificielle « . Une analyse qui prendra en compte, pour la première fois, également des nuances génétiques subtiles entre les individus et les populations, puis comprendra quand le système immunitaire envoie un message d’alerte vraiment significatif pour une personne donnée.

Une autre veine de recherche se concentre cependant sur l’ARN de « déchets », ce qui n’est pas nécessaire pour construire des protéines: « Il y a des milliers de ces ARN et chacun a une action, directe ou indirecte, sur les gènes. Peu à peu, nous commençons à comprendre comment ils fonctionnent », ajoute Carninci.

Étude de l’architecture du cancer

Toujours grâce à l’intelligence artificielle, une autre ligne de recherche émerge: la possibilité de prédire le comportement d’une tumeur – par exemple si elle sera agressive et produira des métastases – et même prédire son génome, uniquement en analysant son « image ». Ou, mieux, sa forme, sa structure et son architecture. « Une sorte de réinterprétation biologique du maximum » Dites-moi avec qui vous allez et je vous dirai qui vous êtes « , dit Piccolo. » Ce n’est qu’en regardant la morphologie de la façon dont les cellules d’un tissu sont disposées dans l’espace que nous pouvons déduire une quantité incroyable d’informations. La raison? Pendant des années – continue piccolo – nous avons considéré le cancer comme une maladie génétique, mais il y en a bien plus. Il s’agit d’un système complexe à l’intérieur d’un écosystème composé de niches écologiques, le célèbre micro-salle des tumeurs. Qui n’est pas organisé en Alast, mais a un ordre architectural précis. La structure est également un ordre architectural précis. fonction « .

Ce n’est qu’en adoptant cette complexité et en apprenant à reconnaître ses géométries dentelées, selon Small, nous pouvons comprendre quelle est la vraie biologie des tumeurs. Mais pour faire tout cela, vous avez besoin de systèmes de calcul très puissants et vous avez également besoin d’images et de données bien collectées ou vous risquez d’être en retard. « L’intelligence artificielle est au début, ce que nous voyons n’est toujours rien. Et les données – concluent le professeur – sont la nouvelle huile ».

Nomination le samedi 11 octobre à 9h30 dans l’Aula Magna de l’Université de Padoue. Invités: Piero Carninci, Stefano Piccolo et Anna Sapino. La participation est gratuite mais il est nécessaire de réserver sur ce lien https://eventi.salute.eu/salute2025